Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudt21Q9CQF3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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