Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CPS8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms