Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CARD8-224ENST00000522431 622 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR4A18P-201ENST00000529103 1088 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139021.1-201ENST00000556734 436 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms