Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms