Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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