Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms