Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

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Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp26Q99MX1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Usp26Q99MX1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Usp26Q99MX1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp26Q99MX1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp26Q99MX1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp26Q99MX1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp26Q99MX1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms