Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms