Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms