Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms