Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd2Q99JR8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms