Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr1Q99JH8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr1Q99JH8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms