Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms