Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TardbpQ921F2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TardbpQ921F2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TardbpQ921F2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TardbpQ921F2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TardbpQ921F2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TardbpQ921F2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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