Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms