Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc58Q8R3Q6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc58Q8R3Q6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc58Q8R3Q6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc58Q8R3Q6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc58Q8R3Q6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc58Q8R3Q6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc58Q8R3Q6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc58Q8R3Q6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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