Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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