Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OptnQ8K3K8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
OptnQ8K3K8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms