Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp45Q8K387 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms