Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms