Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tshz3Q8CGV9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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