Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms