Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3Q5

Shisa7, Protein shisa-7, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa7Q8C3Q5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa7Q8C3Q5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms