Protein–RNA interactions for Protein: Q8C262

Irgc, Interferon-inducible GTPase 5, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IrgcQ8C262 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IrgcQ8C262 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IrgcQ8C262 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms