Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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