Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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