Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem39bQ810L4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms