Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms