Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ScocQ78YZ6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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