Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrt3Q6PE13 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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