Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttbk1Q6PCN3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttbk1Q6PCN3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttbk1Q6PCN3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttbk1Q6PCN3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttbk1Q6PCN3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttbk1Q6PCN3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttbk1Q6PCN3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttbk1Q6PCN3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttbk1Q6PCN3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms