Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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