Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l2Q6KAU8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms