Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Phox2aQ62066 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Phox2aQ62066 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phox2aQ62066 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Phox2aQ62066 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Phox2aQ62066 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Phox2aQ62066 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phox2aQ62066 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Phox2aQ62066 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phox2aQ62066 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phox2aQ62066 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phox2aQ62066 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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