Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcf4Q60722 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf4Q60722 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms