Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uimc1Q5U5Q9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms