Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms