Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930596D02RikQ3V0H9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms