Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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SvipQ3UZP4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SvipQ3UZP4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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