Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc114Q3UX62 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms