Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm5460Q3UQ97 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5460Q3UQ97 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5460Q3UQ97 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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