Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp30Q3UN04 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp30Q3UN04 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp30Q3UN04 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp30Q3UN04 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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