Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ceacam12Q3UKP4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ceacam12Q3UKP4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms