Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms