Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms