Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms