Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc136Q3TVA9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms