Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms