Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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