Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Rpusd2Q149F1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Rpusd2Q149F1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Rpusd2Q149F1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Rpusd2Q149F1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Rpusd2Q149F1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Rpusd2Q149F1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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Rpusd2Q149F1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms